​​​Hos CTF håndterer vi projekter på følgende måde:

1. Kontakt og Baggrundsinformation:

• Afdelinger, klinikker eller andre interessenter kontakter centerlederen med deres projektidé.
• Vi indsamler detaljer om projektets størrelse, baggrund, deadlines og dets formål.
• CTF kan også bruges som bindeled imellem samarbejdspartnere.

2. Planlægning:

• Vi udarbejder en slagplan i samarbejde med projektets ansvarlige.
• Diskussion om hvilke biomarkører der ønskes analyseret, herunder overvejelser om potentielle tilføjelser ud over de allerede identificerede.
• Vi afklarer hvilke type prøver der skal anvendes, herunder om det er prøver fra raske eller syge patienter, stimulerede prøver, spikede prøver, eller interventionsprøver.
• Identifikation af prøvemateriale såsom serum, plasma, fuldblod, celle supernatant, CSF, sårvæske, spyt osv.

3. Pladeoptimering:

• Vi anbefaler altid at udføre en optimering af prøvefortyndingen inden de egentlige analyser påbegyndes.
• Et eksempel på pladeoptimering kunne se sådan her ud: Udvalgte prøver fra en cohorten der indeholder både sputum og plasma som prøvematrix skal analyseres for IL-6. For at finde den optimale fortynding, bliver udvalgte prøver kørt i 10, 50, 100, 175 og 250 folds fortyndinger.  Ud fra de forskellige fortyndinger frem til, at sputum prøverne skulle analyseres i en 250 folds fortynding hvor plasma fra samme patient skulle analyseres i en 50 folds fortynding for at opnå den bedste dynamiske range.​
  

4. Analysemetoder og Bestemmelsesgrad:

• Beslutning om hvorvidt prøverne skal analyseres i dobbelt eller enkelt bestemmelse.
• Dette baseres på en vurdering af forventede niveauer af analytter og økonomiske overvejelser.

5. Prøveaflevering og Analyse:

• Når alle de detaljer er kommet på plads, er vi klar til at modtage hele cohorten her hos CTF. Prøverne bliver opbevaret på -140, -80, -20 eller ved 5 grader alt efter hvad der ønskes indtil de bliver udportioneret, fortyndet og analyseret.
• Analyser udføres i henhold til planen og metodevalg.

6. Dataindsamling og Levering:

• Samtlige analyseresultater samles og præsenteres på en overskuelig måde.
• Data kan leveres løbende i store projekter, men en samlet fil med alle data vil altid blive leveret ved projektets afslutning.
• Denne proces sikrer en systematisk og omhyggelig behandling af projekter for at opnå pålidelige resultater og opfylde projektets formål.​